Käyttäjän työkalut

Sivuston työkalut


paketit:r2151

Sisällysluettelo

R

R 3.2

Uusin testattu versio: 3.2.4

Lataa R 3.2.4:n asennuspaketti. Oletetaan, että paketointiasennuskone käyttää 64-bittistä käyttöjärjestelmää. Käynnistä asennuspaketti ja valitse joko 32- tai 64-bittiset tiedostot Core-tiedostojen lisäksi ja suorita asennus loppuun oletusasetuksin.

Asennuksen jälkeen käynnistä RGui Run as administratorina ja suorita seuraavat komennot sen komentorivillä saadaksesi asennupakettiin mukaan Turun yliopistolla käytössä olevat R:n lisäpaketit:

install.packages(”ctv”) (Tämän käskyn jälkeen valitse CRAN mirroriksi Sweden.)
library(ctv)
install.views(”Finance”)
install.views(”Econometrics”)
install.packages(”limSolve”)
install.packages(”coin”)
install.packages(”itertools”)
install.packages(”languageR”)
install.packages(”party”)
install.packages(”MatchIt”)
install.packages(”rootSolve”)
install.packages(”TSA”)
install.packages(”ltm”)
install.packages(”ISwR”)
install.packages(”genetics”)
install.packages(”RGenetics”)
install.packages(”popgen”)
install.packages(”SASmixed”)
install.packages(”stashR”)
install.packages(”combinat”)
install.packages(”JGR”)
install.pacakges(”lavaan”)
install.packages(”car”)
install.packages(”drc”)
install.packages(”epade”)
install.packages(”fmsb”)
install.packages(”Hmisc”)
install.packages(”mcr”)
install.packages(”moments”)
install.packages(”multcomp”)
install.packages(”nlme”)
install.packages(”OptimalCutpoints”)
install.packages(”pROC”)
install.packages(”psych”)
install.packages(”gplots”)
install.packages(”ResourceSelection”)
install.packages(”xlsx”)
source(”https://bioconductor.org/biocLite.R”)
biocLite(”Rsubread”)
biocLite(”Rsamtools”)
biocLite(”rtracklayer”)
biocLite()
biocLite(”DESeq”)
biocLite(”GenomicFeatures”)
biocLite(”beadarray”)
biocLite(”chipseq”)
biocLite(”cluster”)
biocLite(”edgeR”)
biocLite(”estrogen”)
biocLite(”fpc”)
biocLite(”gplots”)
biocLite(”hgu95av2cdf”)
biocLite(”hgu95av2probe”)
install.packages(”MASS”)
install.packages(”klaR”)
install.packages(”neuralnet”)
install.packages(”ggplot2”)
install.packages(”reshape2”)
install.packages(”lda”)

Näiden pakettien asennuksen jälkeen sulje RGui. Ota regeditillä talteen seuraavat rekisteriavaimet:

HKLM\SOFTWARE\Classes\.Rdata
HKLM\SOFTWARE\Classes\RWorkspace
HKLM\SOFTWARE\R-core (64-bittinen asennus)
HKLM\SOFTWARE\Wow6432Node\R-core (32-bittinen asennus).

32-bittisessä asennuksessa poista .reg-tiedostosta viittaukset Wow6432Nodeen. Yhdistä registry-tiedostot ja talleta yhdistetyt registry-arvot tiedostoon regentries.reg. Kopioi C:\Program Files\R talteen ja näistä tiedostoista ja registry-arvoista .msi-paketti.

R 2.15

Lataa R 2.15.1:n asennuspaketti. Oletetaan, että paketointiasennuskone käyttää 64-bittistä käyttöjärjestelmää. Käynnistä asennuspaketti ja valitse joko 32- tai 64-bittiset tiedostot Core-tiedostojen lisäksi ja suorita asennus loppuun oletusasetuksin.

Asennuksen jälkeen käynnistä RGui Run as administratorina ja suorita seuraavat komennot sen komentorivillä saadaksesi asennupakettiin mukaan Turun yliopistolla käytössä olevat R:n lisäpaketit:

install.packages(”ctv”) (Tämän käskyn jälkeen valitse CRAN mirroriksi Sweden.)
library(ctv)
install.views(”Finance”)
install.views(”Econometrics”)
install.packages(”limSolve”)
install.packages(”xlsReadWrite”)
install.packages(”coin”)
install.packages(”futile”)
install.packages(”itertools”)
install.packages(”languageR”)
install.packages(”party”)
install.packages(”MatchIt”)
install.packages(”rootSolve”)

Näiden pakettien asennuksen jälkeen sulje RGui. Ota regeditillä talteen seuraavat rekisteriavaimet:

HKLM\SOFTWARE\Classes\.Rdata
HKLM\SOFTWARE\Classes\RWorkspace
HKLM\SOFTWARE\R-core (64-bittinen asennus)
HKLM\SOFTWARE\Wow6432Node\R-core (32-bittinen asennus).

32-bittisessä asennuksessa poista .reg-tiedostosta viittaukset Wow6432Nodeen. Yhdistä registry-tiedostot ja talleta yhdistetyt registry-arvot tiedostoon regentries.reg. Kopioi C:\Program Files\R talteen ja näistä tiedostoista ja registry-arvoista .msi-paketti.

paketit/r2151.txt · Viimeksi muutettu: 2016/04/15 09:21 / matronka