| Both sides previous revisionEdellinen revisioSeuraava revisio | Edellinen revisio |
| paketit:r2151 [2013/04/30 09:48] – matronka | paketit:r2151 [2016/04/15 12:21] (nykyinen) – [R 3.2] matronka |
|---|
| ====== R ====== | ====== R ====== |
| |
| ===== R 3.0 ===== | ===== R 3.2 ===== |
| | Uusin testattu versio: 3.2.4 |
| | |
| | Lataa [[http://cran.r-project.org/bin/windows/base/|R 3.2.4:n asennuspaketti]]. Oletetaan, että paketointiasennuskone |
| | käyttää 64-bittistä käyttöjärjestelmää. Käynnistä asennuspaketti ja valitse joko 32- tai 64-bittiset tiedostot |
| | Core-tiedostojen lisäksi ja suorita asennus loppuun oletusasetuksin. |
| | |
| | Asennuksen jälkeen käynnistä RGui Run as administratorina ja suorita seuraavat komennot sen komentorivillä saadaksesi asennupakettiin mukaan Turun yliopistolla |
| | käytössä olevat R:n lisäpaketit: |
| | |
| | ''install.packages("ctv")'' (Tämän käskyn jälkeen valitse CRAN mirroriksi Sweden.)\\ |
| | ''library(ctv)''\\ |
| | ''install.views("Finance")''\\ |
| | ''install.views("Econometrics")''\\ |
| | ''install.packages("limSolve")''\\ |
| | ''install.packages("coin")''\\ |
| | ''install.packages("itertools")''\\ |
| | ''install.packages("languageR")''\\ |
| | ''install.packages("party")''\\ |
| | ''install.packages("MatchIt")''\\ |
| | ''install.packages("rootSolve")''\\ |
| | ''install.packages("TSA")''\\ |
| | ''install.packages("ltm")''\\ |
| | ''install.packages("ISwR")''\\ |
| | ''install.packages("genetics")''\\ |
| | ''install.packages("RGenetics")''\\ |
| | ''install.packages("popgen")''\\ |
| | ''install.packages("SASmixed")''\\ |
| | ''install.packages("stashR")''\\ |
| | ''install.packages("combinat")''\\ |
| | ''install.packages("JGR")''\\ |
| | ''install.pacakges("lavaan")''\\ |
| | ''install.packages("car")''\\ |
| | ''install.packages("drc")''\\ |
| | ''install.packages("epade")''\\ |
| | ''install.packages("fmsb")''\\ |
| | ''install.packages("Hmisc")''\\ |
| | ''install.packages("mcr")''\\ |
| | ''install.packages("moments")''\\ |
| | ''install.packages("multcomp")''\\ |
| | ''install.packages("nlme")''\\ |
| | ''install.packages("OptimalCutpoints")''\\ |
| | ''install.packages("pROC")''\\ |
| | ''install.packages("psych")''\\ |
| | ''install.packages("gplots")''\\ |
| | ''install.packages("ResourceSelection")''\\ |
| | ''install.packages("xlsx")''\\ |
| | ''source("https://bioconductor.org/biocLite.R")''\\ |
| | ''biocLite("Rsubread")''\\ |
| | ''biocLite("Rsamtools")''\\ |
| | ''biocLite("rtracklayer")''\\ |
| | ''biocLite()''\\ |
| | ''biocLite("DESeq")''\\ |
| | ''biocLite("GenomicFeatures")''\\ |
| | ''biocLite("beadarray")''\\ |
| | ''biocLite("chipseq")''\\ |
| | ''biocLite("cluster")''\\ |
| | ''biocLite("edgeR")''\\ |
| | ''biocLite("estrogen")''\\ |
| | ''biocLite("fpc")''\\ |
| | ''biocLite("gplots")''\\ |
| | ''biocLite("hgu95av2cdf")''\\ |
| | ''biocLite("hgu95av2probe")''\\ |
| | ''install.packages("MASS")''\\ |
| | ''install.packages("klaR")''\\ |
| | ''install.packages("neuralnet")''\\ |
| | ''install.packages("ggplot2")''\\ |
| | ''install.packages("reshape2")''\\ |
| | ''install.packages("lda")''\\ |
| | |
| | |
| | Näiden pakettien asennuksen jälkeen sulje RGui. Ota regeditillä talteen seuraavat rekisteriavaimet: |
| | |
| | ''HKLM\SOFTWARE\Classes\.Rdata''\\ |
| | ''HKLM\SOFTWARE\Classes\RWorkspace''\\ |
| | ''HKLM\SOFTWARE\R-core'' (64-bittinen asennus)\\ |
| | ''HKLM\SOFTWARE\Wow6432Node\R-core'' (32-bittinen asennus). |
| | |
| | 32-bittisessä asennuksessa poista .reg-tiedostosta viittaukset Wow6432Nodeen. Yhdistä registry-tiedostot |
| | ja talleta yhdistetyt registry-arvot tiedostoon regentries.reg. Kopioi C:\Program Files\R talteen ja |
| | näistä tiedostoista ja registry-arvoista [[ohjeet:wix|.msi-paketti]]. |
| |
| ===== R 2.15 ===== | ===== R 2.15 ===== |
