Erot

Tämä näyttää erot valitun ja nykyisen version kesken tästä sivusta.

--- paketit:r2151 [2012/09/19 15:30] – matronka
+++ paketit:r2151 [2016/04/15 12:21] (nykyinen) – [R 3.2] matronka
@@ Rivi 1: / Rivi 1: @@
+====== R ======
+===== R 3.2 =====
+Uusin testattu versio: 3.2.4
+Lataa [[http://cran.r-project.org/bin/windows/base/|R 3.2.4:n asennuspaketti]]. Oletetaan, että paketointiasennuskone
+käyttää 64-bittistä käyttöjärjestelmää. Käynnistä asennuspaketti ja valitse joko 32- tai 64-bittiset tiedostot
+Core-tiedostojen lisäksi ja suorita asennus loppuun oletusasetuksin.
+Asennuksen jälkeen käynnistä RGui Run as administratorina ja suorita seuraavat komennot sen komentorivillä saadaksesi asennupakettiin mukaan Turun yliopistolla
+käytössä olevat R:n lisäpaketit:
+''install.packages("ctv")'' (Tämän käskyn jälkeen valitse CRAN mirroriksi Sweden.)\\
+''library(ctv)''\\
+''install.views("Finance")''\\
+''install.views("Econometrics")''\\
+''install.packages("limSolve")''\\
+''install.packages("coin")''\\
+''install.packages("itertools")''\\
+''install.packages("languageR")''\\
+''install.packages("party")''\\
+''install.packages("MatchIt")''\\
+''install.packages("rootSolve")''\\
+''install.packages("TSA")''\\
+''install.packages("ltm")''\\
+''install.packages("ISwR")''\\
+''install.packages("genetics")''\\
+''install.packages("RGenetics")''\\
+''install.packages("popgen")''\\
+''install.packages("SASmixed")''\\
+''install.packages("stashR")''\\
+''install.packages("combinat")''\\
+''install.packages("JGR")''\\
+''install.pacakges("lavaan")''\\
+''install.packages("car")''\\
+''install.packages("drc")''\\
+''install.packages("epade")''\\
+''install.packages("fmsb")''\\
+''install.packages("Hmisc")''\\
+''install.packages("mcr")''\\
+''install.packages("moments")''\\
+''install.packages("multcomp")''\\
+''install.packages("nlme")''\\
+''install.packages("OptimalCutpoints")''\\
+''install.packages("pROC")''\\
+''install.packages("psych")''\\
+''install.packages("gplots")''\\
+''install.packages("ResourceSelection")''\\
+''install.packages("xlsx")''\\
+''source("https://bioconductor.org/biocLite.R")''\\
+''biocLite("Rsubread")''\\
+''biocLite("Rsamtools")''\\
+''biocLite("rtracklayer")''\\
+''biocLite()''\\
+''biocLite("DESeq")''\\
+''biocLite("GenomicFeatures")''\\
+''biocLite("beadarray")''\\
+''biocLite("chipseq")''\\
+''biocLite("cluster")''\\
+''biocLite("edgeR")''\\
+''biocLite("estrogen")''\\
+''biocLite("fpc")''\\
+''biocLite("gplots")''\\
+''biocLite("hgu95av2cdf")''\\
+''biocLite("hgu95av2probe")''\\
+''install.packages("MASS")''\\
+''install.packages("klaR")''\\
+''install.packages("neuralnet")''\\
+''install.packages("ggplot2")''\\
+''install.packages("reshape2")''\\
+''install.packages("lda")''\\
+Näiden pakettien asennuksen jälkeen sulje RGui. Ota regeditillä talteen seuraavat rekisteriavaimet:
+''HKLM\SOFTWARE\Classes\.Rdata''\\
+''HKLM\SOFTWARE\Classes\RWorkspace''\\
+''HKLM\SOFTWARE\R-core'' (64-bittinen asennus)\\
+''HKLM\SOFTWARE\Wow6432Node\R-core'' (32-bittinen asennus).
+-bittisessä asennuksessa poista .reg-tiedostosta viittaukset Wow6432Nodeen. Yhdistä registry-tiedostot
+ja talleta yhdistetyt registry-arvot tiedostoon regentries.reg. Kopioi C:\Program Files\R talteen ja
+näistä tiedostoista ja registry-arvoista [[ohjeet:wix|.msi-paketti]].
+===== R 2.15 =====
 Lataa [[http://cran.r-project.org/bin/windows/base/|R 2.15.1:n asennuspaketti]]. Oletetaan, että paketointiasennuskone
 käyttää 64-bittistä käyttöjärjestelmää. Käynnistä asennuspaketti ja valitse joko 32- tai 64-bittiset tiedostot
@@ Rivi 6: / Rivi 93: @@
 käytössä olevat R:n lisäpaketit:
-''install.packages("ctv")'' (Tämän käskyn jäleen valitse CRAN mirroriksi Sweden.)\\
+''install.packages("ctv")'' (Tämän käskyn jälkeen valitse CRAN mirroriksi Sweden.)\\
 ''library(ctv)''\\
 ''install.views("Finance")''\\
@@ Rivi 18: / Rivi 105: @@
 ''install.packages("party")''\\
 ''install.packages("MatchIt")''\\
+''install.packages("rootSolve")''\\
 Näiden pakettien asennuksen jälkeen sulje RGui. Ota regeditillä talteen seuraavat rekisteriavaimet: